Dr. Mustafa İlter, 2021 yılında Boğaziçi Üniversitesi Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi Enstitüsünde “Geç Osmanlı İmparatorluğu’nda Devlet, Bürokrasi ve İktidar (1908-1913)” başlıklı teziyle doktorasını tamamlamıştır. 2019 yılında Princeton Üniversitesinde misafir araştırmacı olarak görev yapmıştır. Yüksek lisans derecesini 2014 yılında Sabancı Üniversitesinden Tarih alanında, lisans derecesini ise 2012 yılında Boğaziçi Üniversitesinden almıştır.
Çalışmalarını 19. ve 20. yüzyıl Osmanlı tarihi, dünya tarihi, bürokrasi ve devlet teorileri alanlarında sürdüren İlter; dijital beşerî bilimler kapsamında tarihsel sosyal ağ analizi ve doğal dil işleme yöntemleri üzerine uzmanlaşmıştır.
2023 yılından bu yana İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü Genel Kültür Dersleri Bölümünde Öğretim Görevlisi olarak çalışmaktadır. Dr. İlter’in uluslararası dergilerde yayımlanmış makaleleri, projeleri ve konferans bildirileri bulunmaktadır.